publikacje

author
4 minutes, 23 seconds Read

Nir Hacohen, PhD

Massachusetts General Hospital
dyrektor, MGH Center For Cancer Immunotherapy
Center for Cancer Research
149 13th Street, 3rd floor
Charlestown, MA 02129
Broad Institute
7 Cambridge Center
Cambridge, MA 02142
Tel: 617-724-3768
fax: 617-726-5651
email: [email protected]
Lab Members: 6 Postdoctoral Fellows, 3 Graduate Students
odwiedź moją stronę laboratorium tutaj i tutaj.

laboratorium Hacohen składa się z immunologów, genetyków, biochemików, technologów i biologów obliczeniowych pracujących wspólnie nad opracowaniem nowych i bezstronnych strategii zrozumienia podstawowych procesów odpornościowych i chorób o podłożu immunologicznym, z naciskiem na wrodzony układ odpornościowy. Zajmujemy się trzema kluczowymi pytaniami w immunologii: (1) w jaki sposób inicjowane, utrzymywane i unikane są odpowiedzi immunologiczne przeciwko rakowi? (2) Jakie są obwody odpornościowe, które wyczuwają i kontrolują patogeny, takie jak wirusy i bakterie? (3) w jaki sposób rozwija się odporność na organizm, w szczególności u pacjentów z autoimmunologiczną chorobą tocznia. Oprócz odkrywania i badania specyficznych mechanizmów molekularnych i komórkowych, zajmujemy się również tym, w jaki sposób i dlaczego odpowiedź immunologiczna (na nowotwory, patogeny lub Jaźń) zmienia się tak dramatycznie u poszczególnych osób. Wreszcie, dostosowujemy nasze bezstronne strategie analityczne do rzeczywistych terapii, po rozpoczęciu badań klinicznych (z naszym współpracownikiem Dr. Catherine Wu), w którym pacjenci są szczepieni przeciwko własnym guzom za pomocą w pełni spersonalizowanej szczepionki, która jest zaprojektowana w oparciu o analizę obliczeniową ich osobistego genomu nowotworu.
inicjatory, rezystory i cele odporności nowotworów
chociaż immunologia raka była głęboko badana w modelach zwierzęcych, pozostaje wiele otwartych pytań w immunologii nowotworów ludzkich z powodu braku narzędzi do badania próbek ludzkich. Opracowaliśmy metody genetyczne i genomiczne, aby wyjaśnić dużą zmienność odporności przeciwnowotworowej u ludzi i odkryć, w jaki sposób nowotwory ewoluują, aby oprzeć się odporności produktywnej. Niedawno odkryliśmy, że jednym z najlepszych czynników predyktorów odporności przeciwnowotworowej jest obciążenie neoantygenów( zmutowane peptydy prezentowane na powierzchni komórek nowotworowych na cząsteczkach HLA); zidentyfikowaliśmy również mutacje somatyczne w guzach, które indukują lub opierają się odporności przeciwnowotworowej u pacjentów (Rooney et al., Cela 2015). Badania te prowadzą do nowych metod terapeutycznych i celów immunoterapii. W szczególności, opierając się na stwierdzeniu, że pacjenci rozwijają odporność przeciwko zmutowanym neoantygenom pochodzącym z ich nowotworów (Hacohen et al., Cancer Immunology 2013; Rajasagi et al., Blood 2014), opracowaliśmy i obecnie testujemy spersonalizowaną szczepionkę przeciwnowotworową skierowaną do wielu neoantygenów związanych z HLA w guzach ludzkich, wraz z dr Catherine Wu (Dfci).
geny i sieci leżące u podstaw interakcji gospodarz-patogen
opracowaliśmy zestaw strategii integracyjnych do analizy sieci genów zaangażowanych w Wykrywanie lub kontrolowanie patogenów. Zidentyfikowaliśmy szlaki gospodarza wspierające lub ograniczające grypę, takie jak IFITM3 (Shapira et al., Cell 2009), czynniki transkrypcyjne i cząsteczki sygnalizacyjne pośredniczące w wrodzonej odpowiedzi immunologicznej na wirusy i bakterie (Amit et al., Science 2009; Chevrier et al., Cell 2011) oraz składniki wrodzonego wykrywania DNA (Lee et al., Nat Immun 2013). Ostatnio wykazaliśmy, że ekrany CRISPR dla całego genomu skutecznie wykrywają geny zaangażowane w wykrywanie patogenów (Parnas et al., Cell 2015), a teraz używają tego systemu do odkrywania genów zaangażowanych w wykrywanie różnych patogenów i kontrolowanie infekcji wirusowych.
genetyczne podstawy różnic międzyosobniczych odpowiedzi immunologicznych .
Opracowaliśmy również strategie genomowe do analizy ludzkich odpowiedzi immunologicznych i wyjaśnienia fenotypów immunologicznych genotypami linii zarodkowej. Odkryliśmy genetyczne podstawy międzyosobniczej zmienności wrodzonej odpowiedzi immunologicznej na wirusy i bakterie (Lee et al., Science 2014; Raj et al, Science 2014; Ye et al, Science 2014). Na przykład, odkryliśmy, że wspólne allele IRF7 dostrajają siłę indywidualnej odpowiedzi anty-wirusowej. Opierając się na tych badaniach, niedawno opracowaliśmy i stosujemy systematyczne metody analizy roli genetycznych i nie-genetycznych zmian w odporności człowieka i ich wpływu na choroby autoimmunologiczne.
wrodzona odporność kierowców autoimmunizacji.
niedobory nukleaz degradujących DNA prowadzą do gromadzenia się własnego DNA, aktywacji wrodzonych odpowiedzi immunologicznych i rozwoju chorób autoimmunologicznych, w tym tocznia rumieniowatego układowego i zespołu Aicardi-Goutières ’ a u ludzi, oraz autoimmunologicznego zapalenia stawów, zapalenia nerek i zapalenia mięśnia sercowego u myszy. Byliśmy zainteresowani zrozumieniem, jak rozwija się autoimmunizacja po wyzwalaniu wrodzonej odporności przez samo-DNA (zamiast DNA pochodzącego od patogenu). Badając to pytanie, dokonaliśmy zaskakującej obserwacji, że immunostymulujące DNA może powstać z uszkodzonego DNA gospodarza, który jest eksportowany z jądra do lizosomu (Lan et al, Cell Rep 2014). Stawiamy hipotezę, że ten proces komórkowy jest źródłem stanów zapalnych w autoimmunizacji, raku, chemioterapii i starzeniu się. Opracowaliśmy również zintegrowane podejście proteomiczne i genomowe, aby odkryć nowe czynniki i małe cząsteczki ukierunkowane na ten szlak, które mogą być przydatne w leczeniu tych chorób (Lee et al., Nat Imm 2013). Aby pogłębić nasze zrozumienie ścieżek DNA i RNA, które napędzają autoimmunizację, obecnie analizujemy odpowiedzi immunologiczne u pacjentów z toczniowym zapaleniem nerek, z naciskiem na komórkową i molekularną analizę biopsji nerek i próbek krwi od pacjentów z toczniem.

Ostatnia Aktualizacja: 30.07.2015

Similar Posts

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.